Παναθηναϊκός θα έχει στον όμιλο του την πανίσχυρη ΤΣΣΚΑ Μόσχας του Μίλος Τεόντοσιτς, αλλά και τη Ζαλγκρίρις του Ηλία Ζούρου. Η αναμέτρηση της πρεμιέρας του Παναθηναϊκού επιλέχτηκε ως ο παραδοσιακός εναρκτήριος αγώνας της Ευρωλίγκας (2011-2012) στη γενική συνέλευση της διοργανώτριας αρχής στη Βαρκελώνη, πριν την έναρξη της διαδικασίας της κλήρωσης. Ο εναρκτήριος αγώνας θα διεξαχθεί στις 17 Οκτωβρίου, όπως αποφάσισαν οι διοργανωτές.Τα προκριματικά της Ευρωλίγκα θα διεξαχθούν το διάστημα 29 Σεπτεμβρίουμε 2 Οκτωβρίου, με τη διεξαγωγή δύο Final-8 σε δύο διαφορετικές πόλεις. Ο ΠΑΟΚ και η Θεσσαλονίκη διεκδικούν τη διοργάνωση του ενός. Η φάση των ομίλων (24 ομάδες) θα διαρκέσει από τις 17 Οκτωβρίου μέχρι και τις 22 Δεκεμβρίου (Τετάρτες και Πέμπτες για 10 αγωνιστικές όπως ίσχυε και τη σεζόν που ολοκληρώθηκε). Η φάση των «16» θα διεξαχθεί από τις 18 Ιανουαρίου μέχρι και την 1η Μαρτίου με διάλειμμα μίας εβδομάδας ανάμεσα στην 4η και 5η αγωνιστική. Τα πλέι θα αρχίσουν στις 21 Μαρτίου και θα ολοκληρωθούν στις 5 Απριλίου, ενώ το φάιναλ φορ που θα φιλοξενήσει η Κωνσταντινούπολη θα πραγματοποιηθεί το τριήμερο 11-13 Μαϊου.